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叙卷上伤寒论难读并宜补大旨三阳三阴分经名义伤寒重病多是下焦伏寒伏寒触发与伤寒时温脉证并病机异同即病伏气直中传经四证异同晚发是伤寒正病两感有三水气凌心即是三焦伤伤寒杂病皆有之无端暴喘即是寒入命门伤寒杂病
卷一月经前期论（一）月经后期论（二）月经或前或后（三）卷二脉法辨孕男女脉法歌调经经闭崩漏赤白带安胎漏胎胎痛恶阻胎肿子烦子痫子悬子淋胎死上喘胎衣不下产后寒热产后血晕产后腹痛阴户脱卷三调经种子崩漏论赤白带
弁言杨序总评卷上卷下书《人身图说》后书《医林改错》后书《医林改错》后读《全体新论》
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序重刻序卷一升降部围药部内消部内护部卷二化毒部点头部拔毒部去腐部止痛部生肌收口部去管部膏药部卷三疔疮部喉症部诸疮部卷四疮部癣疮部痔疮部口牙部鼻耳部脚部补遗
卷一明目赋（一）眼科论孙真人谕眼论阴阳相应辨论上古天真论眼科通明论轩辕黄帝说眼病目科四季五行发挥妙诀明目赋（二）太玄真人论眼病五轮所属太玄真人问眼病因论八廓所属八卦也论五轮受病之因论八廓受实热病之因论
陈序童序自序增补本草备要自序本草备要凡例药性总义内容草部黄甘草人参沙参丹参元参白术苍术葳蕤黄精狗脊石斛远志石菖蒲牛膝甘菊花五味子天门冬麦门冬款冬花紫菀旋复花百部桔梗荠马兜铃白前白芨半夏天南星贝母栝楼仁
金疮赋按脉论行拳法分轻重论打人论总论秘授跌打损伤要诀金枪论接骨诸方金枪不治症又接骨议论方
喉部论喉症喉症总论辨喉症经络治法喉科辨症双松症单松症双燕子症单燕子症双鹅症单鹅症双缠症单缠症悬蜞症合架症圹症瘰症乘枕症乘颚症斗底症HT症联珠症破头症掩头症大头症穿额症鱼鳞症玉笋症莲花症梅花症黑疔症抢食