序卷上医之可法或问手足太阳、手足阳明、手足少阳、俱会于首、然六阳会于首者、亦有阴乎经脉终始日用人肖天地问脾寄于坤如何．是损至第三．若从脾为．第二从肾为第四请言脾数明经络之数有几问三焦有几问脏腑有几伤寒
凡例卷首前贤医案五脏所司兼五行所属（图缺）动功六字延寿诀太极阴阳动静致病例五轮定位之图八廓定位之图（图缺）五轮歌括五脏主病八廓歌括八廓主病脏腑表里三阴三阳轮廓贯通五运之图六气之图逐年六气总论卷一五轮所
《仁斋直指》序卷之一总论五脏所主论五脏病证虚实论诸阴诸阳论血营气卫论脉病逆顺论男女气血则一论问病论论《易简方论》附∶原脉论（出《保命集》）附论五篇（出《丹溪心法》）附∶十二经脉歌火湿分治论虚实分治论附
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序序八穴灸法头部二穴手部二穴背腹部二穴足部二穴梓桑君针道传宗图（缺）百穴法歌折量法补泻手法穴法图寅手太阴肺经卯手阳明大肠经辰足阳明胃经巳足太阴脾经午手少阴心经未手太阳小肠经申足太阳膀胱经酉足少阴肾经戌
自序凡例（六则）卷一 中风门中风（类中导入）卷二 诸伤门伤寒暑（参绪论暑证）湿（湿热）燥火伤饮食劳倦虚损（传尸）卷三 寒热门发热热潮热恶寒（背恶寒）振寒战栗寒热疟厥卷三 诸气门上气郁痞满腹满水
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序卷之一头目卷之二耳鼻舌卷之三口面项喉卷之四心神卷之五胸腹卷之六身卷之七背手足卷之八溺孔肛门
序一序二高士宗先生手授医学真传医道失传医门经论五运六气六淫外感七情内伤脏腑经络三焦命门气血水火阴阳部位原病治病方药婴儿痘附案伤寒发热恶寒头痛辨舌咳嗽疟暑痢喘呃嚏胀肿蛊隔吐血衄血便血心腹痛中风胎产用药大