叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
第一节 中药的含义第二节 中药的品种第三节 中药的命名第四节 中药的分类第五节 中药的产地第六节 中药的采集第七节 中药的性能一、五味二、四气三、升降浮沉四、补泻五、归经六、毒性第八节 中药的配伍第九
自叙卷上·经络脏腑无气存亡论躯壳经络脏腑论表里上下论阴阳升降论治病必分经络脏腑论治病不必分经络脏腑论肾藏精论一脏一腑先绝论君火相火论卷上·脉诊脉决死生论症脉轻重论脉症与病相反论卷上·病中风论臌膈论寒热
呼吸系统疾病感冒支气管炎大叶性肺炎肺脓肿消化系统疾病慢性胃炎胃与十二指肠溃疡胃下垂膈肌痉挛胰腺炎细菌性痢疾乙型肝炎循环系统疾病心律失常动脉粥样硬化高血压和高血压性心脏病冠心病肺原性心脏病心功能不全泌尿
序一序二序三序四凡例十六则劝医六则七方论十剂论辟陶隐居十剂内增入寒热二剂论辟缪仲醇十剂内增升降二剂论卷之一（宫集）人参黄芪甘草白术苍术熟地生地当归牛膝远志石菖蒲卷之二（商集）天门冬麦门冬五味子菟丝子甘
卷上论疮肿诊候入式法论荣卫色脉参应之法论持手诀消息法论三部所主脏腑病证论脉证名状二十六种所主病证论三部脉所主证候论三部脉所主杂病法诀论诊候肺疽肺痿法论将护忌慎法论疮疽肿虚实法辨疮肿浅深法辨脓法辨疮疽疖
汪序自序乔序凡例卷一《内经》纂要上古天真论篇四气调神大论篇生气通天论篇金匮真言论篇阴阳应象大论篇阴阳离合论篇阴阳别论篇灵兰秘典论篇六节脏象论篇五脏生成篇五脏别论篇移精变气论篇汤液醪醴论篇诊要经终论篇脉
卷一序论卷二卷三卷四黄父一疽论相痈疽知是非可灸法相痈知有脓可破法卷五
序自序续序凡例卷之上痧症发蒙论玉衡要语痧分表里辨治痧宜看凉热唇舌辨大小便宜通咽喉治法治痧当绝其根痧原论治痧当分经络痧与杂症轻重不同治痧三法痧前禁忌痧后禁忌痧胀凶症痧为百病变症医家当识痧筋放痧有十放痧须
序一序二序三卷一卷二卷三疹痧疹附录吴山散记小引吴山散记