卷一明目赋（一）眼科论孙真人谕眼论阴阳相应辨论上古天真论眼科通明论轩辕黄帝说眼病目科四季五行发挥妙诀明目赋（二）太玄真人论眼病五轮所属太玄真人问眼病因论八廓所属八卦也论五轮受病之因论八廓受实热病之因论
序卷上十干脏腑配合十二支脏腑经络配合手足经络配天地四时合主表里阴阳脏腑经络病证内外八邪内外病生四类九气五邪五邪微甚十干夫妇配合成五运五运太过不及十二支应六气三阴三阳六气有余不足六气五运应五脏主病六气为
茧唇一口疮二齿痛三舌症四喉痹诸症五喉痛六诸骨稻谷发鲠七治诸鲠咒法八误吞水蛭九诸虫入耳十蛇入七窍及虫咬伤十一男女体气十二附方并注
序序医家源流卷之上评脉（一）察视（二）五脏（三）汗吐下温水火刺灸八法（四）五脏虚实(五)五脏绝死（六）脉（七）周身经穴（八）伤寒（九）六经（十）时行疫疠（十一）湿（十二）寒热往来（十三）恶寒（十四）背
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
醉花窗医案
一、发散解表紫苏粥葱白粥干葛粥生姜粥葱豉粥神仙粥发汗鼓粥姜苏饮姜糖葱白饮银花簿荷饮菜根红糖饮罗汉果饮葱豉汤香薷饮桑叶菊花饮蜜糖银花露杭菊糖茶二、化痰止咳江米粥牛蒡粥阿胶粥杏仁蒸肉白果鸡丁玉参焖鸭虫草鹌
妇科百辩
黄帝内经素问序重广补注黄帝内经素问序自序新刻叙卷一 养生上古天真论一四气调神论二金匮真言论三生气通天论四阴阳应象论五卷二 脏象十二脏相使论六五脏别论七五脏生成论八脏气法时论九宣明五气十卷二 脉法经脉别
序一序二序三凡例卷之一万金一统述药性歌诸病主药释形体周身脏腑形状人身面背手足之图（缺）十二经脉歌手太阴肺经脉歌∶手阳明大肠经脉歌∶足阳明胃经脉歌∶足太阴脾经脉歌∶手少阴心经脉歌∶手太阳小肠经脉歌∶足太