明目论看眼诀图眼病歌诀冷眼歌诀热眼歌诀药性光明赋五经虚泻五经火眼目虚实冷热论点药药性炮炼法男女禁忌看眼法演药法点药法制药法煎膏法研药法合药法用药法服药法禁忌主药方辅药方加减方按五轮治疗捷法四季加减煎药
难经正义
自序卷一一明望色之法望色论（附律一条）一明闻声之法闻声论（附律二条）一明辨息之法辨息论（附律一条）一明胸中大气之法大气论（附律一条）一明问病之法问病论（附律一条）一明切脉之法切脉论（附律一条）一明合色
自序卷之一·治法通论卷之一·调经门经候总论经闭血崩赤白带下白浊白淫卷之二·杂症门上（杂证男女一也。此二卷方论，出女科书，多杂病书所遗，故存之耳。）虚劳客热寒热恶寒中风飞尸血厥螈颤振惊悸颠狂血风烦闷血风
卷上详注灵枢素问伏气化温诸条详注难经伏气发温诸条详注仲景伏气化温证治各条附注仲景暴感暑热证治各条附注仲景兼感湿温证治各条卷中辨正周禹载温热暑疫各条辨正蒋问斋医略伏邪篇辨正张石顽伤寒绪论温热各条辨正吴又
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并
卷一安胎论辨胎歌养胎安胎小产卷二恶阻胎痛胎漏跌扑伤胎毒药伤胎胎动满闷子肿子气卷三子悬子烦子痫子淋淋闭溺血遗尿转胞中风中恶眩晕卷四心痛心腹痛小腹痛腰腹背痛子鸣积聚咳嗽霍乱不语泄泻痢疟疾烦渴热病胎蒸吐衄爽
析骨分经
兰台轨范
卷一用药弊端说卷一各症辩认阴阳用药法眼心病不安肺病咳嗽肺痿肺痈胃病不食脾病呕吐泄泻肝病筋挛肾病腰痛头痛目病耳病肿痛鼻流清涕鼻孔煽动唇口红肿齿牙肿痛口臭[附:口苦、口酸、口辛、口甘、口淡、口糜]舌肿、舌